Kırgızistan-Türkiye Manas Üniversitesi 6 Ağustos 1996 tarih ve 22719 sayılı T.C. Resmi Gazete'de yayımlanan 96/8350 sayılı Milletlerarası Anlaşma uyarınca kurulmuş özel statüye sahip bir yüksek öğretim kurumudur.

Üniversitenin genel yönetimi, ortak işletme-ortak idare prensibinden hareketle, taraf hükümetlerce atanan sekiz kişiden müteşekkil bir Mütevelli Heyet tarafından yürütülmektedir. Heyet Başkanı ve üç üye Türkiye Cumhuriyeti Hükümeti tarafından müşterek kararname ile atanmakta, Heyet'in diğer dört üyesi ise Kırgız Eğitim ve Bilim Bakanlığı'nın teklifi üzerine Kırgız Cumhuriyeti Hükümeti tarafından cari usullere göre tayin edilmektedir.

	Yusuf TEKİN Başkan  Milli Eğitim Bakanlığı Müsteşarı		Muhammedkalıy ABILGAZİYEV Üye  Kırgız Cumhuriyeti Başbakanı
	Adnan ERTÜRK Üye Maliye Bakanlığı Gelir İdaresi Başkanı		Üye  Kırgız Cumhuriyeti Başbakan Yardımcısı
	Prof. Dr. Mehmet ŞİŞMAN Üye Yükseköğretim Kurulu Üyesi		Gulmira KUDAYBERDİYEVA Üye  Kırgız Cumhuriyeti Eğitim ve Bilim Bakanı
	Prof. Dr. Yavuz ATAR Üye Yükseköğretim Kurulu Üyesi		Albek İBRAYİMOV  Üye  Bişkek Büyük Şehir Belediye Başkanı