2011-жылдын 26-апрелиндеги Кыргыз-Түрк “Манас” университетинин мындан аркы ишмердүүлүгү жөнүндө келишимдин 7-беренесине ылайык университеттин окуу, башкаруу жана финансылык ишмердүүлүгү, ошондой эле Камкорчулар кеңешинин каржылык чыгымдары жана башка иш-чаралары текшерүү комиссиясы тарабынан көзөмөлдөнөт. Текшерүү комиссиясы кыргыз жана түрк тараптан 4 адамдан түзүлүп, жалпы 8 адамдан турат. Текшерүү комиссиясынын кыргыз тараптан мүчөлөрү Кыргыз Республикасынын Өкмөтүнүн токтому менен дайындалат. Текшерүү комиссиясынын төрагасы комиссиянын мүчөлөрүнүн ичинен тараптардын өз ара макулдашуусу боюнча ар бир тараптан кезек менен 2 жылдык мөөнөткө дайындалат. Текшерүү комиссиясынын мүчөлөрүнүн ыйгарым укуктарынын мөөнөтү 5 (беш) жылды түзөт.
Проф., док. Нажи Гундоган,
Төрага,
Түркия Республикасынын Жогорку билим берүү комитетинин аткаруу кеңешинин мүчөсү
Жибек Дуйшеева,
Мүчө,Каржы министринин орун басары
Проф., док. Рахми Эр,
Мүчө,
Түркия Республикасынын Жогорку билим берүү комитетинин мүчөсү
Проф., док. Абылабек Асанканов,
Мүчө,
КРнын Улуттук илимдер академиясынын мүчө-корреспонденти
Проф., док. Метин Топчуоглу,
Мүчө,
Түркия Республикасынын Жогорку билим берүү комитетинин төрагасынын орун басары/ аткаруу кеңешинин мүчөсү
Проф., док. Төлөбек Абдырахманов,
Мүчө,
Ж.Баласагын атындагы Кыргыз улуттук университетинин ректору
Исмаил Эраслан,
Мүчө,
Түркия Республикасынын Каржы министрлигине караштуу Стратегиялык пландоо башкармалыгынын башчысы
Салмарбек Асанов,
Мүчө,
Кыргыз Республикасынын Билим берүү жана илим министрлигине караштуу Бюджеттик саясат, финансылык талдоо жана инвестициялар башкармалыгынын башкы адиси